Lost Sphear улучшит все особенности предыдущей части - I am Setsuna, так, мир игры станет бесшовным, а также обновится боевая система и другие аспекты геймплея.
По сюжету игры, молодой парень Каната, проснувшись от сна, собирается найти свой родной город, который исчез без следа. Чтобы спасти мир от полного исчезновения, Каната и его друзья будут восстанавливать все по кусочкам, силой Памяти превращая мысли в материю.