Самус отправляется на планету ZDR, откуда поступил загадочный сигнал для Галактической Федерации. Планета оказалась захвачена враждебными организмами и машинами — роботы E.M.M.I. будут постоянно настигать героиню.
В игре будут новые и уже знакомые способности Самус, апгрейд снаряжения, поиск пути по запутанной карте, паркур поможет найти секретные места.